仁王3中，卑弥呼作为贯穿主线的核心人物，其存在深刻影响着整个故事的脉络和主题表达。游戏中设有壹个极具深意的温泉彩蛋，需在不同时代分别和两位决定因素女性人物共浴温泉方可触发：其一为平安时代后进入古代地图时和卑弥呼同浴，其二则是在解开幕末时代后，重返战国时期的龙潭寺再次泡汤，此时井伊直虎将凝望水面，流露出若有所思的神情，并触发成就“昔日的记忆”。

该彩蛋并非单纯趣味设计，而是对人物关系和叙事内核的重要揭示——静御前、卑弥呼、井伊直虎等主要女性人物虽身处不同时代，容貌却高度相似。这一设定暗示她们之间存在深层的灵魂延续性，极也许指给同一灵魂在不同时空的转生或具现。

具体操作途径如下：完成平安时代主线后，进入古代地图，前往指定区域沿阶梯下行，即可抵达温泉地点；和卑弥呼一同入浴时，她会略带不满地质疑此举是否徒耗光阴。随后，在推进至江户时代并开始幕末篇章后，前往神社战绘卷，从头挑战战国章节中的“龙潭寺的怨灵”任务，抵达龙潭寺温泉后再次泡汤，彩蛋即被激活。

除了这些之后，游戏同步上线了功能完备的互动地图工具，涵盖全部神社位置、技能典籍、武士和忍者遗发等核心收集要素，可有效辅助玩家高效寻觅和完整收集。